Die Stadt erreichte ihre Blütezeit in den Jahren 600-1000. Die Bewohner unterhielten Beziehungen zu anderen Maya-Städten auf der Yucatan und im Petén in Guatemala.

Um 900-1000 ließ sich Cobá in einen  Kampf mit Chichen Itza ein und wurde besiegt.

Die Anlage ist sehr weitläufig, man kann zu Fuß die Anlage erkunden, sich ein Fahrrad mieten oder ein Bici-Taxi anheuern, um mehrere Bereiche des Geländes zu erkunden.